| 1 |
AbyMBEL891 |
Acinetobacter baumannii |
650 |
891 |
778 |
Bacteria |
2010年 |
| 2 |
iAbaylyiV4 |
Acinetobacter baylyi |
774 |
875 |
701 |
Bacteria |
2008年 |
| 3 |
iYLW1028 |
Actinoplanes sp. |
1028 |
1219 |
1128 |
Bacteria |
2015年 |
| 4 |
GMD-FH1894 |
Amycolatopsis balhimycina |
583 |
1363 |
647 |
Bacteria |
2012年 |
| 5 |
iRL766 |
Ashbya gossypii |
766 |
1595 |
799 |
Eukaryota |
2013年 |
| 6 |
iHD666 |
Aspergillus nidulans |
666 |
794 |
732 |
Eukaryota |
2008年 |
| 7 |
iMA871 |
Aspergillus niger |
871 |
1190 |
1045 |
Eukaryota |
2008年 |
| 8 |
GMD-RIB40 |
Aspergillus oryzae |
1314 |
1053 |
1073 |
Eukaryota |
2008年 |
| 9 |
iJL1454 |
Aspergillus terreus |
1454 |
1451 |
1155 |
Eukaryota |
2013年 |
| 10 |
iMZ1055 |
Bacillus megaterium |
1055 |
1112 |
993 |
Bacteria |
2013年 |
| 11 |
model_v3 |
Bacillus subtilis |
844 |
1020 |
988 |
Bacteria |
2007年 |
| 12 |
iBsu1103 |
Bacillus subtilis |
1103 |
1437 |
1138 |
Bacteria |
2009年 |
| 13 |
iBif452 |
Bifidobacterium adolescentis |
452 |
699 |
611 |
Bacteria |
2014年 |
| 14 |
iCG230 |
Blattabacterium cuenoti |
358 |
289 |
230 |
Bacteria |
2012年 |
| 15 |
iCG238 |
Blattabacterium cuenoti |
364 |
296 |
238 |
Bacteria |
2012年 |
| 16 |
iMP240 |
Blattabacterium cuenoti |
240 |
412 |
317 |
Bacteria |
2013年 |
| 17 |
GMD-B. pertussi |
Bordetella pertussis |
|
|
|
Bacteria |
2012年 |
| 18 |
iGT196 |
Buchnera aphidicola |
196 |
263 |
240 |
Bacteria |
2009年 |
| 19 |
iKF1028 |
Burkholderia cenocepacia |
1028 |
859 |
834 |
Bacteria |
2011年 |
| 20 |
GMD-NCTC11168 |
Campylobacter jejuni |
388 |
536 |
467 |
Bacteria |
2011年 |
| 21 |
iNX804 |
Candida glabrata |
804 |
1287 |
1025 |
Eukaryota |
2012年 |
| 22 |
iBD1106 |
Chlamydomonas reinhardtii |
1106 |
2445 |
1959 |
Eukaryota |
2014年 |
| 23 |
AlgaGEM |
Chlamydomonas reinhardtii |
1371 |
1725 |
1862 |
Eukaryota |
2011年 |
| 24 |
iRC1080 |
Chlamydomonas reinhardtii |
1080 |
2190 |
1068 |
Eukaryota |
2011年 |
| 25 |
iOA584 |
Chromohalobacter salexigens |
584 |
1386 |
1411 |
Bacteria |
2011年 |
| 26 |
GMD-ATCC824a |
Clostridium acetobutylicum |
474 |
552 |
422 |
Bacteria |
2008年 |
| 27 |
GMD-ATCC824b |
Clostridium acetobutylicum |
432 |
502 |
479 |
Bacteria |
2008年 |
| 28 |
iFs431 |
Clostridium acetobutylicum |
431 |
603 |
621 |
Bacteria |
2010年 |
| 29 |
iCac802 |
Clostridium acetobutylicum |
802 |
1462 |
1137 |
Bacteria |
2014年 |
| 30 |
iCM925 |
Clostridium beijerinckii |
925 |
938 |
881 |
Bacteria |
2011年 |
| 31 |
iHN637 |
Clostridium ljungdahlii |
637 |
785 |
698 |
Bacteria |
2013年 |
| 32 |
iSR432 |
Clostridium thermocellum |
432 |
577 |
525 |
Bacteria |
2010年 |
| 33 |
iJM658 |
Corynebacterium glutamicum |
658 |
1065 |
984 |
Bacteria |
2015年 |
| 34 |
GMD-ATCC13032b |
Corynebacterium glutamicum |
|
446 |
411 |
Bacteria |
2008年 |
| 35 |
GMD-ATCC13032a |
Corynebacterium glutamicum |
227 |
502 |
423 |
Bacteria |
2009年 |
| 36 |
iNV213 |
Cryptosporidium hominis |
213 |
540 |
|
Eukaryota |
2010年 |
| 37 |
iCyt773 |
Cyanothece sp. |
773 |
946 |
802 |
Bacteria |
2012年 |
| 38 |
iCce806 |
Cyanothece sp. |
806 |
667 |
637 |
Bacteria |
2012年 |
| 39 |
iAI549 |
Dehalococcoides ethenogenes |
549 |
518 |
549 |
Bacteria |
2010年 |
| 40 |
iDsh827 |
Dinoroseobacter shibae |
827 |
1488 |
1614 |
Bacteria |
2013年 |
| 41 |
EctoGEM-1.0 |
Ectocarpus siliculosus |
|
1866 |
2020 |
Eukaryota |
2014年 |
| 42 |
GMD-V583 |
Enterococcus faecalis |
|
706 |
642 |
Bacteria |
2014年 |
| 43 |
EcoCyc-18.0-GEM |
Escherichia coli |
1445 |
2286 |
1453 |
Bacteria |
2014年 |
| 44 |
iCA1273 |
Escherichia coli |
1273 |
2477 |
1111 |
Bacteria |
2011年 |
| 45 |
iJO1366 |
Escherichia coli |
1366 |
2251 |
1136 |
Bacteria |
2011年 |
| 46 |
iAF1260 |
Escherichia coli |
1260 |
2077 |
1039 |
Bacteria |
2007年 |
| 47 |
iJR904 |
Escherichia coli |
904 |
931 |
625 |
Bacteria |
2003年 |
| 48 |
iHJ873 |
Escherichia coli |
773 |
873 |
518 |
Bacteria |
2006年 |
| 49 |
iJE660 |
Escherichia coli |
660 |
627 |
438 |
Bacteria |
2000年 |
| 50 |
iFap484 |
Faecalibacterium prausnitzii |
484 |
713 |
621 |
Bacteria |
2014年 |
| 51 |
GMD-A2-165 |
Faecalibacterium prausnitzii |
602 |
1030 |
833 |
Bacteria |
2014年 |
| 52 |
iRS605 |
Francisella tularensis |
683 |
605 |
586 |
Bacteria |
2010年 |
| 53 |
iAF987 |
Geobacter metallireducens |
987 |
1284 |
1109 |
Bacteria |
2014年 |
| 54 |
GMD-GS-15 |
Geobacter metallireducens |
747 |
697 |
769 |
Bacteria |
2009年 |
| 55 |
GMD-ATCC51573 |
Geobacter sulfurreducens |
588 |
523 |
541 |
Bacteria |
2006年 |
| 56 |
iXW433 |
Gluconobacter oxydans |
433 |
859 |
985 |
Bacteria |
2014年 |
| 57 |
GMD-NBRC16433 |
Gordonia alkanivorans |
568 |
922 |
881 |
Bacteria |
2013年 |
| 58 |
iJE296 |
Haemophilus influenzae |
296 |
488 |
343 |
Bacteria |
1999年 |
| 59 |
iCS400 |
Haemophilus influenzae |
400 |
461 |
451 |
Bacteria |
2003年 |
| 60 |
GMD-R-1 |
Halobacterium salinarum |
490 |
711 |
557 |
Archaea |
2008年 |
| 61 |
iCS291 |
Helicobacter pylori |
291 |
388 |
340 |
Bacteria |
2002年 |
| 62 |
iIT341 |
Helicobacter pylori |
341 |
476 |
485 |
Bacteria |
2005年 |
| 63 |
iWZ663 |
Ketogulonicigenium vulgare |
663 |
830 |
649 |
Bacteria |
2012年 |
| 64 |
KoxGSC1457 |
Klebsiella oxytoca |
1074 |
1457 |
1099 |
Bacteria |
2013年 |
| 65 |
iYL1228 |
Klebsiella pneumoniae |
1228 |
1970 |
1658 |
Bacteria |
2011年 |
| 66 |
iOD907 |
Kluyveromyces lactis |
907 |
2180 |
2338 |
Eukaryota |
2014年 |
| 67 |
iLca334_548 |
Lactobacillus casei |
548 |
1040 |
959 |
Bacteria |
2014年 |
| 68 |
iJL846 |
Lactobacillus casei |
846 |
969 |
785 |
Bacteria |
2014年 |
| 69 |
iLca12A_640 |
Lactobacillus casei |
640 |
1076 |
979 |
Bacteria |
2014年 |
| 70 |
GMD-WCFS1 |
Lactobacillus plantarum |
721 |
643 |
531 |
Bacteria |
2006年 |
| 71 |
GMD-IL1403 |
Lactococcus lactis |
358 |
621 |
422 |
Bacteria |
2005年 |
| 72 |
GMD-MG1363 |
Lactococcus lactis subsp. cremoris |
518 |
754 |
650 |
Bacteria |
2013年 |
| 73 |
iAC560 |
Leishmania major |
560 |
1112 |
1101 |
Eukaryota |
2008年 |
| 74 |
GMD-MBEL55Ea |
Mannheimia succiniciproducens |
425 |
686 |
519 |
Bacteria |
2007年 |
| 75 |
GMD-MBEL55Eb |
Mannheimia succiniciproducens |
355 |
373 |
332 |
Bacteria |
2004年 |
| 76 |
iMM518 |
Methanococcus maripaludis |
518 |
570 |
556 |
Archaea |
2014年 |
| 77 |
iMB745 |
Methanosarcina acetivorans |
745 |
756 |
715 |
Archaea |
2011年 |
| 78 |
iVS941 |
Methanosarcina acetivorans |
941 |
705 |
708 |
Archaea |
2011年 |
| 79 |
iAF692 |
Methanosarcina barkeri |
692 |
619 |
558 |
Archaea |
2006年 |
| 80 |
iMG746 |
Methanosarcina barkeri |
746 |
741 |
719 |
Archaea |
2013年 |
| 81 |
iRP911 |
Methylobacterium extorquens |
911 |
1139 |
977 |
Bacteria |
2011年 |
| 82 |
iAI558 |
Moorella thermoacetica |
558 |
705 |
697 |
Bacteria |
2015年 |
| 83 |
iCY1106 |
Mortierella alpina |
1106 |
1856 |
1733 |
Eukaryota |
2014年 |
| 84 |
iNJ661m |
Mycobacterium tuberculosis |
663 |
1049 |
838 |
Bacteria |
2010年 |
| 85 |
GSMN-TB |
Mycobacterium tuberculosis |
726 |
849 |
739 |
Bacteria |
2007年 |
| 86 |
iNJ661 |
Mycobacterium tuberculosis |
661 |
939 |
828 |
Bacteria |
2007年 |
| 87 |
iPS189 |
Mycoplasma genitalium |
189 |
262 |
274 |
Bacteria |
2009年 |
| 88 |
iJW145 |
Mycoplasma pneumoniae |
145 |
306 |
266 |
Bacteria |
2013年 |
| 89 |
GMD-DSM2160 |
Natronomonas pharaonis |
654 |
683 |
597 |
Archaea |
2010年 |
| 90 |
Nmb_iTM560 |
Neisseria meningitidis |
586 |
1255 |
1297 |
Bacteria |
2011年 |
| 91 |
GMD-serogroup B |
Neisseria meningitidis |
555 |
496 |
471 |
Bacteria |
2007年 |
| 92 |
iJDZ836 |
Neurospora crassa |
836 |
1845 |
1008 |
Eukaryota |
2013年 |
| 93 |
iPC1209 |
Pectobacterium carotovorum subsp. Carotovorum |
1209 |
2235 |
1113 |
Bacteria |
2014年 |
| 94 |
iAL1006 |
Penicillium chrysogenum |
1006 |
1471 |
1235 |
Eukaryota |
2013年 |
| 95 |
iLC915 |
Pichia pastoris |
915 |
1423 |
899 |
Eukaryota |
2012年 |
| 96 |
iPP668 |
Pichia pastoris |
668 |
1361 |
1177 |
Eukaryota |
2010年 |
| 97 |
PpaMBEL1254 |
Pichia pastoris |
540 |
1254 |
1147 |
Eukaryota |
2010年 |
| 98 |
iSS884 |
Pichia stipitis |
884 |
1332 |
992 |
Eukaryota |
2012年 |
| 99 |
GMD-3D7a |
Plasmodium falciparum |
366 |
1001 |
616 |
Eukaryota |
2010年 |
| 100 |
GMD-3D7b |
Plasmodium falciparum |
579 |
1375 |
1622 |
Eukaryota |
2010年 |
| 101 |
iVM679 |
Porphyromonas gingivalis |
|
679 |
564 |
Bacteria |
2009年 |
| 102 |
iMF721 |
Pseudoalteromonas haloplanktis |
721 |
1322 |
1133 |
Bacteria |
2014年 |
| 103 |
iMO1056 |
Pseudomonas aeruginosa |
1056 |
883 |
760 |
Bacteria |
2008年 |
| 104 |
iSB1139 |
Pseudomonas fluorescens |
1139 |
1012 |
1194 |
Bacteria |
2013年 |
| 105 |
PpuMBEL1071 |
Pseudomonas putida |
900 |
1071 |
1044 |
Bacteria |
2010年 |
| 106 |
iJP815 |
Pseudomonas putida |
815 |
877 |
886 |
Bacteria |
2008年 |
| 107 |
iJN746 |
Pseudomonas putida |
746 |
950 |
911 |
Bacteria |
2008年 |
| 108 |
iPB890 |
Pseudomonas stutzeri |
890 |
1135 |
813 |
Bacteria |
2015年 |
| 109 |
RehMBEL1391 |
Ralstonia eutropha |
|
1391 |
1171 |
Bacteria |
2011年 |
| 110 |
iOR450 |
Rhizobium etli |
450 |
402 |
377 |
Bacteria |
2012年 |
| 111 |
iOR363 |
Rhizobium etli |
363 |
387 |
371 |
Bacteria |
2007年 |
| 112 |
iRsp1095 |
Rhodobacter sphaeroides |
1095 |
1158 |
796 |
Bacteria |
2011年 |
| 113 |
GMD-PR4 |
Rhodococcus erythropolis |
618 |
823 |
786 |
Bacteria |
2011年 |
| 114 |
iMT1174 |
Rhodococcus jostii |
1174 |
1935 |
1243 |
Bacteria |
2015年 |
| 115 |
GMD-T118 |
Rhodoferax ferrireducens |
744 |
762 |
790 |
Bacteria |
2009年 |
| 116 |
iIN800 |
Saccharomyces cerevisiae |
800 |
1446 |
1013 |
Eukaryota |
2008年 |
| 117 |
iFF708 |
Saccharomyces cerevisiae |
708 |
1175 |
584 |
Eukaryota |
2003年 |
| 118 |
iLL672 |
Saccharomyces cerevisiae |
672 |
1038 |
636 |
Eukaryota |
2005年 |
| 119 |
iND750 |
Saccharomyces cerevisiae |
750 |
1149 |
646 |
Eukaryota |
2004年 |
| 120 |
iMM904 |
Saccharomyces cerevisiae |
904 |
1412 |
713 |
Eukaryota |
2009年 |
| 121 |
iMH805 |
Saccharomyces cerevisiae |
832 |
1857 |
1168 |
Eukaryota |
2008年 |
| 122 |
Yeast 1.0 |
Saccharomyces cerevisiae |
|
1102 |
924 |
Eukaryota |
2010年 |
| 123 |
iTO977 |
Saccharomyces cerevisiae |
977 |
1566 |
1353 |
Eukaryota |
2013年 |
| 124 |
GMD-NRRL2338 |
Saccharopolyspora erythraea |
2075 |
1482 |
1646 |
Bacteria |
2012年 |
| 125 |
SPNV1.0 |
Saccharopolyspora spinosa |
733 |
1577 |
1726 |
Bacteria |
2014年 |
| 126 |
iCC908 |
Salinispora tropica |
908 |
1507 |
1317 |
Bacteria |
2015年 |
| 127 |
STM_v1.0 |
Salmonella enterica |
1270 |
2201 |
1119 |
Bacteria |
2011年 |
| 128 |
iMA945 |
Salmonella enterica |
945 |
1964 |
1036 |
Bacteria |
2009年 |
| 129 |
iRR1083 |
Salmonella enterica |
1083 |
1087 |
774 |
Bacteria |
2009年 |
| 130 |
GMD-LT2 |
Salmonella Typhimurium |
824 |
1097 |
1088 |
Bacteria |
2014年 |
| 131 |
iTL885 |
Scheffersomyces stipitis |
885 |
1240 |
589 |
Eukaryota |
2012年 |
| 132 |
iCY1170_DHA |
Schizochytrium limacinum |
1170 |
1769 |
1659 |
Eukaryota |
2015年 |
| 133 |
SpoMBEL1693 |
Schizosaccharomyces pombe |
605 |
1744 |
1693 |
Eukaryota |
2012年 |
| 134 |
iOS217_672 |
Shewanella denitrificans |
672 |
865 |
638 |
Bacteria |
2014年 |
| 135 |
iMR1_799 |
Shewanella oneidensis |
799 |
933 |
647 |
Bacteria |
2014年 |
| 136 |
iSO783 |
Shewanella oneidensis |
783 |
774 |
634 |
Bacteria |
2010年 |
| 137 |
iMR4_812 |
Shewanella sp. |
812 |
986 |
665 |
Bacteria |
2014年 |
| 138 |
iW3181_789 |
Shewanella sp. |
789 |
918 |
643 |
Bacteria |
2014年 |
| 139 |
iHZ565 |
Sinorhizobium meliloti |
565 |
503 |
522 |
Bacteria |
2012年 |
| 140 |
GMD-morsitans |
Sodalis glossinidius |
668 |
741 |
690 |
Bacteria |
2012年 |
| 141 |
iAK692 |
Spirulina platensis |
692 |
875 |
837 |
Bacteria |
2012年 |
| 142 |
iMH551 |
Staphylococcus aureus |
551 |
712 |
604 |
Bacteria |
2005年 |
| 143 |
iSB619 |
Staphylococcus aureus |
619 |
641 |
571 |
Bacteria |
2005年 |
| 144 |
Many |
Staphylococcus aureus |
546 |
1493 |
1431 |
Bacteria |
2009年 |
| 145 |
GMD-LMG18311 |
Streptococcus thermophilus |
429 |
522 |
|
Bacteria |
2009年 |
| 146 |
GMD-A3(2)b |
Streptomyces coelicolor |
700 |
700 |
500 |
Bacteria |
2005年 |
| 147 |
GMD-A3(2)a |
Streptomyces coelicolor |
789 |
1015 |
759 |
Bacteria |
2010年 |
| 148 |
GMD-TK24 |
Streptomyces lividans |
|
702 |
602 |
Bacteria |
2012年 |
| 149 |
GMD-NRRL18488 |
Streptomyces tsukubaensis |
671 |
865 |
621 |
Bacteria |
2013年 |
| 150 |
iTU515 |
Sulfolobus solfataricus |
515 |
718 |
705 |
Bacteria |
2012年 |
| 151 |
iSyf715 |
Synechococcus elongatus |
715 |
851 |
838 |
Bacteria |
2014年 |
| 152 |
GMD-PCC7002 |
Synechococcus sp |
|
|
|
Bacteria |
2013年 |
| 153 |
iSyn731 |
Synechocystis sp |
731 |
1156 |
860 |
Bacteria |
2012年 |
| 154 |
GMD-PCC6803 |
Synechocystis sp. |
633 |
831 |
704 |
Bacteria |
2008年 |
| 155 |
iJN678 |
Synechocystis sp. |
678 |
863 |
795 |
Bacteria |
2012年 |
| 156 |
iSyn669 |
Synechocystis sp. |
669 |
882 |
790 |
Bacteria |
2010年 |
| 157 |
iWT236 |
Thermoanaerobacter tengcongensis |
236 |
253 |
227 |
Bacteria |
2013年 |
| 158 |
GMD-JW-YS485 |
Thermoanaerobacterium saccharolyticum |
315 |
515 |
503 |
Bacteria |
2015年 |
| 159 |
iTfu296 |
Thermobifida fusca |
296 |
975 |
1382 |
Bacteria |
2014年 |
| 160 |
iZY478 |
Thermotoga maritima |
478 |
562 |
503 |
Bacteria |
2009年 |
| 161 |
iTT548 |
Thermus thermophilus |
548 |
796 |
635 |
Bacteria |
2014年 |
| 162 |
VvuMBEL943 |
Vibrio vulnificus |
673 |
943 |
792 |
Bacteria |
2011年 |
| 163 |
GMD-B100 |
Xanthomonas campestris pv. Campestris |
352 |
437 |
338 |
Bacteria |
2013年 |
| 164 |
iYL619_PCP |
Yarrowia lipolytica |
619 |
1142 |
843 |
Eukaryota |
2012年 |
| 165 |
iNL895 |
Yarrowia lipolytica |
895 |
2002 |
1847 |
Eukaryota |
2012年 |
| 166 |
iPC815 |
Yersinia pestis |
815 |
1678 |
963 |
Bacteria |
2011年 |
| 167 |
iAN818m |
Yersinia pestis |
818 |
1020 |
825 |
Bacteria |
2009年 |
| 168 |
iZM363 |
Zymomonas mobilis |
363 |
747 |
704 |
Bacteria |
2010年 |
| 169 |
ZmobMBEL601 |
Zymomonas mobilis |
347 |
601 |
579 |
Bacteria |
2010年 |